全区林业自然保护区内物种数居全国第三，保护了全区80%的陆地生态系统、20%的重要湿地和33%的红树林，并保存了广西原生性最好的天然阔叶林。保护区每年涵蓄水量达64.8亿立方米，是全区4536座水库有效库容量106.69亿立方米的60.7%，涵养和调节了全区364条大小河流、666个水库，发挥了“天然绿色水库”的作用。这些自然保护区广泛分布在全区石漠化最严重的红水河、柳江、左右江等流域，对遏制生态恶化，维护生态平衡，保障国土安全发挥了极为重要的作用；同时自然保护区还保存有8000多种高等植物和800多种陆生脊椎野生动物，均占全区野生动物种群和高等植物种群的90%以上，是白头叶猴、黑叶猴、瑶山鳄蜥、金斑喙凤蝶等150多种国家重点保护野生动物的主要栖息地，银杉、冷杉、红豆杉、苏铁等120多种濒危野生植物的重点分布区，以及桂西南石灰岩植物、九万山植物、大瑶山植物等三大广西植物特有现象中心的生物多样性关键地区，均在保护区内得到了有效保护。

　　建立自然保护区是保护自然资源和生态系统，维护国土生态安全和人与自然和谐共存，促进经济社会可持续发展的有效措施。自治区党委、政府和各级林业部门历来高度重视自然保护区工作，作出了一系列重大决策和部署，制定了相应的政策措施推动自然保护区建设。2001年，国家启动了野生动植物保护和自然保护区建设工程，野生动植物保护和自然保护区建设工程成为新世纪六大林业工程之一。广西被纳入该工程建设范围，至2006年共获得国家工程建设资金4353万元，地方财政配套投入资金1821万元。同时，自治区财政每年还安排专项资金，用于自然保护区的资源考察与总体规划、人员培训、政策研究等。全区先后制定了自然保护区建设总体规划，完成了30个保护区资源综合考察和25个保护区规划，新建了7个保护区，大明山、猫儿山、十万大山、千家洞、岑王老山、九万山6处保护区升格为国家级自然保护区。

　　各级政府把林业自然保护区事业的发展纳入本地经济和社会发展总体规划。花坪、猫儿山、大明山等自然保护区在社区共管、社区联防机制的推行当中作了积极尝试，保护区成为全区开展生态文明教育、弘扬人与自然和谐共处理念的重要基地，成为人们普及自然科学知识的重要场所；自然保护区的设立，也为自然资源科学研究提供了重要平台和有利条件